Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIC1Q15915 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIC1Q15915 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZIC1Q15915 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZIC1Q15915 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIC1Q15915 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms