Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFX1Q12986 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NFX1Q12986 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFX1Q12986 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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