Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSMC1P62191 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC1P62191 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC1P62191 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PSMC1P62191 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMC1P62191 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms