Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOX10P56693 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOX10P56693 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOX10P56693 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOX10P56693 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SOX10P56693 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SOX10P56693 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SOX10P56693 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SOX10P56693 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SOX10P56693 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOX10P56693 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOX10P56693 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOX10P56693 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOX10P56693 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOX10P56693 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOX10P56693 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOX10P56693 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOX10P56693 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SOX10P56693 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SOX10P56693 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SOX10P56693 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SOX10P56693 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SOX10P56693 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SOX10P56693 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOX10P56693 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOX10P56693 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOX10P56693 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOX10P56693 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOX10P56693 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOX10P56693 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOX10P56693 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOX10P56693 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOX10P56693 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOX10P56693 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SOX10P56693 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOX10P56693 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOX10P56693 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SOX10P56693 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOX10P56693 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOX10P56693 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOX10P56693 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOX10P56693 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SOX10P56693 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SOX10P56693 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOX10P56693 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOX10P56693 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOX10P56693 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOX10P56693 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOX10P56693 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOX10P56693 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SOX10P56693 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOX10P56693 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOX10P56693 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOX10P56693 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOX10P56693 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOX10P56693 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOX10P56693 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOX10P56693 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOX10P56693 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOX10P56693 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOX10P56693 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOX10P56693 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOX10P56693 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOX10P56693 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOX10P56693 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOX10P56693 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOX10P56693 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOX10P56693 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SOX10P56693 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOX10P56693 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOX10P56693 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SOX10P56693 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOX10P56693 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOX10P56693 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOX10P56693 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOX10P56693 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOX10P56693 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOX10P56693 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SOX10P56693 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOX10P56693 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOX10P56693 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOX10P56693 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOX10P56693 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOX10P56693 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOX10P56693 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOX10P56693 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOX10P56693 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOX10P56693 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOX10P56693 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOX10P56693 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOX10P56693 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOX10P56693 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOX10P56693 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOX10P56693 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOX10P56693 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOX10P56693 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOX10P56693 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOX10P56693 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOX10P56693 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOX10P56693 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms