Protein–RNA interactions for Protein: P56177

DLX1, Homeobox protein DLX-1, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLX1P56177 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DLX1P56177 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLX1P56177 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLX1P56177 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLX1P56177 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DLX1P56177 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLX1P56177 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLX1P56177 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLX1P56177 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLX1P56177 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLX1P56177 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLX1P56177 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DLX1P56177 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLX1P56177 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLX1P56177 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLX1P56177 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLX1P56177 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLX1P56177 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLX1P56177 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLX1P56177 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLX1P56177 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DLX1P56177 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLX1P56177 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLX1P56177 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLX1P56177 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLX1P56177 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DLX1P56177 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLX1P56177 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLX1P56177 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLX1P56177 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLX1P56177 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLX1P56177 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLX1P56177 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLX1P56177 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DLX1P56177 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLX1P56177 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLX1P56177 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DLX1P56177 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DLX1P56177 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
DLX1P56177 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLX1P56177 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLX1P56177 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLX1P56177 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLX1P56177 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLX1P56177 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLX1P56177 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLX1P56177 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLX1P56177 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLX1P56177 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLX1P56177 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLX1P56177 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLX1P56177 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLX1P56177 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DLX1P56177 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DLX1P56177 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DLX1P56177 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DLX1P56177 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DLX1P56177 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DLX1P56177 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DLX1P56177 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DLX1P56177 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DLX1P56177 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DLX1P56177 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DLX1P56177 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DLX1P56177 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DLX1P56177 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DLX1P56177 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DLX1P56177 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DLX1P56177 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DLX1P56177 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DLX1P56177 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DLX1P56177 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DLX1P56177 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DLX1P56177 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DLX1P56177 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DLX1P56177 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DLX1P56177 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DLX1P56177 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DLX1P56177 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DLX1P56177 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DLX1P56177 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DLX1P56177 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DLX1P56177 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DLX1P56177 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DLX1P56177 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DLX1P56177 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DLX1P56177 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DLX1P56177 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DLX1P56177 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DLX1P56177 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DLX1P56177 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DLX1P56177 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DLX1P56177 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLX1P56177 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLX1P56177 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DLX1P56177 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLX1P56177 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLX1P56177 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLX1P56177 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DLX1P56177 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms