Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB3P54753 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB3P54753 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB3P54753 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPHB3P54753 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPHB3P54753 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms