Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD8P48556 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD8P48556 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD8P48556 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD8P48556 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD8P48556 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms