Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF2RBP32927 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF2RBP32927 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RBP32927 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RBP32927 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF2RBP32927 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSF2RBP32927 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF2RBP32927 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms