Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA2P29317 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA2P29317 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EPHA2P29317 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHA2P29317 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms