Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXP28300 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXP28300 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXP28300 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXP28300 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXP28300 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXP28300 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXP28300 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXP28300 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LOXP28300 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LOXP28300 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LOXP28300 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LOXP28300 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LOXP28300 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LOXP28300 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LOXP28300 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LOXP28300 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LOXP28300 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LOXP28300 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LOXP28300 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LOXP28300 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LOXP28300 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXP28300 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXP28300 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXP28300 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXP28300 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXP28300 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXP28300 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LOXP28300 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXP28300 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXP28300 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXP28300 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXP28300 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LOXP28300 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LOXP28300 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXP28300 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXP28300 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXP28300 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LOXP28300 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LOXP28300 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LOXP28300 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LOXP28300 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LOXP28300 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXP28300 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LOXP28300 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LOXP28300 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LOXP28300 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXP28300 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXP28300 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXP28300 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXP28300 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LOXP28300 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LOXP28300 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LOXP28300 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LOXP28300 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LOXP28300 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXP28300 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXP28300 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXP28300 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXP28300 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXP28300 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LOXP28300 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXP28300 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXP28300 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXP28300 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXP28300 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LOXP28300 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LOXP28300 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LOXP28300 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXP28300 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXP28300 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXP28300 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXP28300 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXP28300 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXP28300 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LOXP28300 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LOXP28300 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LOXP28300 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LOXP28300 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXP28300 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXP28300 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXP28300 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXP28300 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXP28300 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXP28300 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXP28300 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXP28300 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXP28300 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXP28300 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXP28300 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms