Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
VCAM1P19320 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VCAM1P19320 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VCAM1P19320 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VCAM1P19320 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VCAM1P19320 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms