Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB1P16220 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB1P16220 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB1P16220 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB1P16220 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB1P16220 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB1P16220 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB1P16220 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB1P16220 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB1P16220 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB1P16220 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB1P16220 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB1P16220 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB1P16220 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB1P16220 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB1P16220 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB1P16220 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB1P16220 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB1P16220 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB1P16220 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB1P16220 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CREB1P16220 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB1P16220 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB1P16220 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB1P16220 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CREB1P16220 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB1P16220 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB1P16220 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB1P16220 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREB1P16220 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB1P16220 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB1P16220 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB1P16220 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREB1P16220 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB1P16220 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB1P16220 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB1P16220 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB1P16220 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREB1P16220 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREB1P16220 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREB1P16220 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREB1P16220 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB1P16220 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB1P16220 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB1P16220 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB1P16220 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREB1P16220 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB1P16220 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB1P16220 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB1P16220 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB1P16220 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB1P16220 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREB1P16220 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB1P16220 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB1P16220 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB1P16220 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB1P16220 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB1P16220 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB1P16220 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB1P16220 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB1P16220 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB1P16220 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB1P16220 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB1P16220 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB1P16220 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB1P16220 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB1P16220 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB1P16220 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB1P16220 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB1P16220 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB1P16220 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB1P16220 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB1P16220 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB1P16220 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB1P16220 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB1P16220 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB1P16220 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB1P16220 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB1P16220 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB1P16220 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB1P16220 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB1P16220 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB1P16220 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB1P16220 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB1P16220 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB1P16220 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB1P16220 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB1P16220 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB1P16220 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB1P16220 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB1P16220 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB1P16220 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB1P16220 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB1P16220 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB1P16220 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB1P16220 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB1P16220 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB1P16220 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB1P16220 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB1P16220 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms