Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PABPC1P11940 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPC1P11940 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PABPC1P11940 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PABPC1P11940 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC1P11940 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms