Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP2CP0DJJ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRGAP2CP0DJJ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP2CP0DJJ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP2CP0DJJ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms