Protein–RNA interactions for Protein: O75888

TNFSF13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13O75888 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13O75888 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFSF13O75888 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFSF13O75888 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13O75888 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201 ms