Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC6AO75865 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC6AO75865 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6AO75865 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms