Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EIF3JO75822 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EIF3JO75822 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF3JO75822 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF3JO75822 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms