Protein–RNA interactions for Protein: O75131

CPNE3, Copine-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE3O75131 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPNE3O75131 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE3O75131 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE3O75131 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE3O75131 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE3O75131 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE3O75131 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms