Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNGR2O43760 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGR2O43760 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms