Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4DGG1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
B4DGG1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
B4DGG1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
B4DGG1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
B4DGG1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4DGG1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4DGG1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
B4DGG1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4DGG1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4DGG1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4DGG1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
B4DGG1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4DGG1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4DGG1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4DGG1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4DGG1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4DGG1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4DGG1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4DGG1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4DGG1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4DGG1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4DGG1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4DGG1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4DGG1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4DGG1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
B4DGG1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4DGG1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4DGG1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4DGG1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4DGG1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4DGG1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
B4DGG1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4DGG1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4DGG1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
B4DGG1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4DGG1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4DGG1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4DGG1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4DGG1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4DGG1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4DGG1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4DGG1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
B4DGG1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
B4DGG1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4DGG1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DGG1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DGG1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DGG1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DGG1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DGG1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4DGG1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4DGG1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
B4DGG1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4DGG1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
B4DGG1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4DGG1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4DGG1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4DGG1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4DGG1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4DGG1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
B4DGG1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
B4DGG1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
B4DGG1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4DGG1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4DGG1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4DGG1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4DGG1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DGG1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DGG1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DGG1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DGG1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DGG1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DGG1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DGG1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4DGG1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4DGG1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4DGG1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4DGG1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4DGG1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
B4DGG1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4DGG1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4DGG1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4DGG1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4DGG1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4DGG1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
B4DGG1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4DGG1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4DGG1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4DGG1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4DGG1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4DGG1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4DGG1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4DGG1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
B4DGG1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4DGG1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4DGG1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4DGG1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4DGG1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4DGG1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms