Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM202A6NGA9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM202A6NGA9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM202A6NGA9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM202A6NGA9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms