Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZNF316A6NFI3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF316A6NFI3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZNF316A6NFI3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZNF316A6NFI3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ZNF316A6NFI3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZNF316A6NFI3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF316A6NFI3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF316A6NFI3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF316A6NFI3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF316A6NFI3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF316A6NFI3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF316A6NFI3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZNF316A6NFI3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ZNF316A6NFI3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF316A6NFI3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF316A6NFI3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms