Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE3

EFCAB10, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB10A6NFE3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFCAB10A6NFE3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFCAB10A6NFE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB10A6NFE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB10A6NFE3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms