Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF804BA4D1E1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF804BA4D1E1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF804BA4D1E1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZNF804BA4D1E1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF804BA4D1E1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF804BA4D1E1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF804BA4D1E1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF804BA4D1E1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF804BA4D1E1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF804BA4D1E1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ZNF804BA4D1E1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZNF804BA4D1E1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNF804BA4D1E1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZNF804BA4D1E1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZNF804BA4D1E1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZNF804BA4D1E1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZNF804BA4D1E1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZNF804BA4D1E1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZNF804BA4D1E1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZNF804BA4D1E1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF804BA4D1E1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF804BA4D1E1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF804BA4D1E1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF804BA4D1E1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF804BA4D1E1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms