Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCML2Q9UQR0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCML2Q9UQR0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCML2Q9UQR0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCML2Q9UQR0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms