Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SORCS3Q9UPU3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SORCS3Q9UPU3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SORCS3Q9UPU3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SORCS3Q9UPU3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms