Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4CQ9UP65 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLA2G4CQ9UP65 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLA2G4CQ9UP65 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLA2G4CQ9UP65 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLA2G4CQ9UP65 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G4CQ9UP65 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms