Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARDHQ9UL12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SARDHQ9UL12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SARDHQ9UL12 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SARDHQ9UL12 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SARDHQ9UL12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms