Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LSM7Q9UK45 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LSM7Q9UK45 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LSM7Q9UK45 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LSM7Q9UK45 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LSM7Q9UK45 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM7Q9UK45 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms