Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC38A7Q9NVC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC38A7Q9NVC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC38A7Q9NVC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC38A7Q9NVC3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC38A7Q9NVC3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms