Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA3Q9NST1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA3Q9NST1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA3Q9NST1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA3Q9NST1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA3Q9NST1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.1 ms