Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX5

NPDC1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPDC1Q9NQX5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPDC1Q9NQX5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPDC1Q9NQX5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPDC1Q9NQX5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPDC1Q9NQX5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms