Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC1

JADE2, E3 ubiquitin-protein ligase Jade-2, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JADE2Q9NQC1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
JADE2Q9NQC1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
JADE2Q9NQC1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
JADE2Q9NQC1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
JADE2Q9NQC1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
JADE2Q9NQC1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
JADE2Q9NQC1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
JADE2Q9NQC1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
JADE2Q9NQC1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
JADE2Q9NQC1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
JADE2Q9NQC1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
JADE2Q9NQC1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
JADE2Q9NQC1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms