Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUGCTQ9HAC7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUGCTQ9HAC7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUGCTQ9HAC7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUGCTQ9HAC7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUGCTQ9HAC7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SUGCTQ9HAC7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUGCTQ9HAC7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SUGCTQ9HAC7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUGCTQ9HAC7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUGCTQ9HAC7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms