Protein–RNA interactions for Protein: Q9H977

WDR54, WD repeat-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR54Q9H977 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR54Q9H977 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR54Q9H977 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WDR54Q9H977 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR54Q9H977 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms