Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMCQ9BYG8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMCQ9BYG8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSDMCQ9BYG8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSDMCQ9BYG8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms