Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCZQ96LD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCZQ96LD1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGCZQ96LD1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGCZQ96LD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms