Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MS4A3Q96HJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A3Q96HJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A3Q96HJ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A3Q96HJ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A3Q96HJ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms