Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC120Q96HB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC120Q96HB5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC120Q96HB5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC120Q96HB5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms