Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3IP1Q96FE7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3IP1Q96FE7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3IP1Q96FE7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3IP1Q96FE7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3IP1Q96FE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms