Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSPC1Q8WXF1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSPC1Q8WXF1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSPC1Q8WXF1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSPC1Q8WXF1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSPC1Q8WXF1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PSPC1Q8WXF1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms