Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPUSD2Q8IZ73 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPUSD2Q8IZ73 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RPUSD2Q8IZ73 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPUSD2Q8IZ73 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms