Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RASSF3Q86WH2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASSF3Q86WH2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RASSF3Q86WH2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF3Q86WH2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RASSF3Q86WH2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms