Protein–RNA interactions for Protein: Q86U90

YRDC, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YRDCQ86U90 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YRDCQ86U90 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YRDCQ86U90 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YRDCQ86U90 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YRDCQ86U90 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YRDCQ86U90 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YRDCQ86U90 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms