Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
HECW1Q76N89 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
HECW1Q76N89 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
HECW1Q76N89 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
HECW1Q76N89 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
HECW1Q76N89 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
HECW1Q76N89 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
HECW1Q76N89 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
HECW1Q76N89 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
HECW1Q76N89 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
HECW1Q76N89 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.54■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
HECW1Q76N89 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.46■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
HECW1Q76N89 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
HECW1Q76N89 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
HECW1Q76N89 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms