Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL6Q6ICC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL6Q6ICC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTL6Q6ICC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTL6Q6ICC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTL6Q6ICC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms