Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP19-7Q3SYF9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms