Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCBP1Q09161 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCBP1Q09161 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCBP1Q09161 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms