Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL8P80075 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL8P80075 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL8P80075 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL8P80075 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL8P80075 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL8P80075 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL8P80075 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL8P80075 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL8P80075 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL8P80075 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL8P80075 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL8P80075 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL8P80075 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL8P80075 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL8P80075 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL8P80075 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL8P80075 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL8P80075 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL8P80075 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL8P80075 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL8P80075 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL8P80075 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL8P80075 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL8P80075 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL8P80075 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL8P80075 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL8P80075 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL8P80075 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL8P80075 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL8P80075 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL8P80075 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL8P80075 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL8P80075 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL8P80075 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL8P80075 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL8P80075 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL8P80075 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL8P80075 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL8P80075 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL8P80075 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL8P80075 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL8P80075 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL8P80075 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL8P80075 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL8P80075 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL8P80075 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL8P80075 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL8P80075 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL8P80075 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCL8P80075 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCL8P80075 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCL8P80075 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCL8P80075 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCL8P80075 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL8P80075 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL8P80075 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL8P80075 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL8P80075 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL8P80075 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL8P80075 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCL8P80075 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL8P80075 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL8P80075 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL8P80075 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL8P80075 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCL8P80075 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL8P80075 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL8P80075 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCL8P80075 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL8P80075 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL8P80075 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCL8P80075 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL8P80075 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL8P80075 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCL8P80075 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL8P80075 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL8P80075 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCL8P80075 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCL8P80075 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL8P80075 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL8P80075 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL8P80075 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCL8P80075 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCL8P80075 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL8P80075 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCL8P80075 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL8P80075 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL8P80075 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL8P80075 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL8P80075 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL8P80075 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCL8P80075 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL8P80075 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL8P80075 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL8P80075 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL8P80075 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL8P80075 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL8P80075 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL8P80075 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms