Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP107P57740 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP107P57740 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP107P57740 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP107P57740 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP107P57740 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP107P57740 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP107P57740 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP107P57740 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP107P57740 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP107P57740 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP107P57740 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP107P57740 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP107P57740 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP107P57740 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP107P57740 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP107P57740 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP107P57740 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP107P57740 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP107P57740 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP107P57740 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP107P57740 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP107P57740 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP107P57740 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP107P57740 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP107P57740 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP107P57740 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP107P57740 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP107P57740 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP107P57740 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP107P57740 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP107P57740 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP107P57740 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP107P57740 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP107P57740 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP107P57740 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP107P57740 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP107P57740 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP107P57740 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP107P57740 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP107P57740 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP107P57740 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP107P57740 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP107P57740 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP107P57740 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP107P57740 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP107P57740 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP107P57740 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP107P57740 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP107P57740 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP107P57740 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP107P57740 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP107P57740 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP107P57740 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP107P57740 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP107P57740 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP107P57740 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP107P57740 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP107P57740 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP107P57740 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP107P57740 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP107P57740 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP107P57740 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP107P57740 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP107P57740 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP107P57740 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP107P57740 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP107P57740 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP107P57740 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP107P57740 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP107P57740 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP107P57740 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP107P57740 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP107P57740 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP107P57740 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP107P57740 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP107P57740 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP107P57740 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP107P57740 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP107P57740 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP107P57740 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP107P57740 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP107P57740 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUP107P57740 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP107P57740 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP107P57740 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP107P57740 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP107P57740 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP107P57740 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP107P57740 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms